Спустя два года после событий первого сезона Дэн [空操弾馬] и его друзья наслаждаются тихой и спокойной жизнью. Внезапно перед Дэном открывается портал, из которого прибывает Драго. Драго просит своего напарника помочь ему спасти Новую Вестрою от захвативших его родину вестов. Прибыв на Новую Вестрою, Дэн и последовавший за ним Маручо [丸蔵兆治] встречают бойцов Фронта Освобождения Бакуган: бойца [[Сабтерры]] Миру [ミラ・フェルミン], бойца [[Даркуса]] Эйса [エース・グリッド] и бойца [[Хаоса]] Бэйрона [バロン・リッチ]. Вместе с ними наши главные герои начинают противостояние шести сильнейшим бойцам среди вестов — вексам.
